基本情况：
韩智杰博士本、硕、博分别毕业也贵州大学、哈尔滨工业大学和重庆大学，生物信息学专业。自2020年起，供职于重庆医科大学基础医学院，特聘副教授，硕士研究生导师。
科研方向：
利用生物信息学方法，重点关注和研究神经类疾病（CNS disorders）在基因组和转录组层面上的发病机理。兴趣点主要集中在：基因组和转录组数据分析，二代测序数据分析， 单细胞测序数据分析。 Genome-wide association study (GWAS)， Single nucleotide polymorphism (SNP)， Long non-coding RNA (lncRNA)， Expression quantitative trait loci (eQTL)， Alzheimer’s Disease (AD)， Multiple sclerosis (MS)。此外，meta分析，孟德尔随机化，算法和数据库的开发也有涉猎。
发表论文：
1. Han Z, Wei B, Zhang C, et al. PARK16 rs708730 polymorphism decreases Parkinson’s Disease risk in European ancestry population: a meta-analysis. Journal of Geriatric Medicine. 2020; doi: https://doi.org/10.30564/jgm.v1i2.798.
2. Han Z, Xue W, Tao L, et al. Genome-wide identification and analysis of the eQTL lncRNAs in multiple sclerosis based on RNA-seq data. Brief Bioinform. 2020, 21: 1023-1037.
3. Han Z, Hua J, Xue W, et al. Integrating the RNA-seq data from various studies to explore multiple sclerosis-related lncRNAs and their functions. Front Genet. 2019; 10: 1136.
4. Han Z, Xue W, Tao L, et al. Identification of key long non-coding RNAs in the pathology of Alzheimer's Disease and their functions based on genome-wide associations study, microarray, and RNA-seq data. J Alzheimers Dis. 2019; 68: 339-355.
5. Han Z, Xue W, Tao L, et al. Identification of novel immune-relevant drug target genes for Alzheimer's Disease by combining ontology inference with network analysis. CNS Neurosci Ther. 2018; 24: 1253-1263.
6. Han Z, Qu J, Zhao J, et al. Genetic variant rs755622 regulates expression of the multiple sclerosis severity modifier D-dopachrome tautomerase in a sex-specific way. Biomed Res Int. 2018; 2018: 8285653.
7. Han Z, Qu J, Zhao J, et al. Analyzing 74,248 samples confirms the association between CLU rs11136000 polymorphism and Alzheimer's Disease in caucasian but not Chinese population. Sci Rep. 2018; 8: 11062.
8. Han Z, Jiang Q, Zhang T, et al. Analyzing large-scale samples confirms the association between the rs1051730 polymorphism and lung cancer susceptibility. Sci Rep. 2015; 5: 15642.
9. Han Z, Qu J, Zhang X, et al. Using mathematical modeling to analyze the mortality of Tetranychus urticae infested by Hirsutella thompsonii. Chinese Journal of Applied Entomology. 2013; 50: 406-412.
10. Ding W, Xu L, Zhang L, Han Z, Jiang Q, Wang Z, Jin S. Meta-analysis of association between TCF7L2 polymorphism rs7903146 and type 2 diabetes mellitus. BMC Med Genet. 2018; 19: 38.
11. Tan R, Wang J, Wu X, Wan G, Wang R, Ma R, Han Z, Zhou W, Jin S, Jiang Q ERDS-pe: A paired hidden Markov model for copy number variant detection from whole-exome sequencing data. In: Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), 2016 IEEE International Conference on, 2016. IEEE, pp 141-144.
12. Jiang Q, Wang J, Wu X, Ma R, Zhang T, Jin S, Han Z, Tan R, Peng J, Liu G, Li Y, Wang Y. LncRNA2Target: a database for differentially expressed genes after lncRNA knockdown or overexpression. Nucleic Acids Res. 2015; 43: D193-196.
招生说明：
从事生物信息学研究的人大致可以粗略地分为三类。第一类主要由数学相关专业出身的人组成。他们主要从事设计和开发底层算法的工作。第二类主要由计算机相关专业出身的人组成。他们主要进行生物信息学软件和数据库的开发。包括我在内的第三类，主要由生物医学相关专业出身的人组成。他们致力于利用生物信息学方法解决生物学问题。
我的研究工作（包括正在进行和计划的）主要涉及三个方向。它们全部都围绕神经类疾病展开。首先，最主要的一个方向是基因组和转录组层面上的数据分析和挖掘，包括：芯片、bulk和单细胞测序等的数据。其次，一些源自公卫领域的计算工作有时也会开展。比如：meta分析、孟德尔随机化等。再次，如果自身的课题需要，也会进行某些新的算法和数据库的开发。当然，我还只是科研界的一个小学生。大概在未来很长的一段时期内，都只能以一种边学习边工作的方式开展我的课题。所以我们可以抽时间，一起来多读读论文，学学相关的课程。
我希望我未来学生在科研上的目标和我的大致相符，并以研究探索和阅读撰写论文为乐趣。我很愿意鼓励你将科学研究作为一生的事业。若能如此，我们的利害得失可能更容易趋近于一致。在这个前提下，我希望可以为我的团队创造一个自由的环境。让权利义务对等。每个人被充分授权，同时承担相应的结果。如合作者般对待，如朋友般相处。我们相互学习，共同进步。把科研工作当成一场游戏，我们一起闯关、打怪、升级。如果你有不错的思路，我会尽量让你自由地安排时间、课题等等方面。如果你完全是一个新手，我会详细地告诉你每一步该怎么做，直到你能独当一面。当然，我猜测更多的情况是介于这两者之间。
以上就是我想对我未来学生所说的话。欢迎生物医学、计算机和数学等相关专业背景的同学报考我的研究生（如果你没有这些背景却依然喜欢，同样欢迎）。也欢迎感兴趣的本科生过来一起工作学习。
邮箱：zhijiehan@cqmu.edu.cn
