个人简介
文波，遗传学博士，长江学者特聘教授，国家重大科学研究计划（973）首席科学家，重庆医科大学基础医学院院长，医学表观遗传中心主任。主要从事人类遗传学及表观遗传学相关领域的研究，发表学术论文48篇，被引用>7500次。其中，作为第一或通讯作者在Nature、Nature Genetics、Molecular Cell、Genome Research等期刊发表研究型论文20余篇。近五年来，课题组围绕“染色质高级结构的功能及分子机制”这一前沿科学问题进行研究，以核基质（Nuclear Matrix）、核体（Nuclear Bodies）等细胞核超微环境为切入点，揭示了多个新的染色质高级结构调控分子及作用机制。近五年主持国家重大科学研究计划、国家基金委重点项目等国家级科研项目4项，总经费超过3400万元。
教育背景及工作简历
1993-1997 云南大学生物系 学士
1997-2000 云南大学生物系 硕士，导师：肖春杰
2000-2004 复旦大学遗传所，博士，导师：金力
2005-2009 美国霍普金斯大学医学系，博士后，导师：Andrew Feinberg
2009-2010美国霍普金斯大学医学系讲师
2010-2017复旦大学生物医学研究院研究员
2017-2023 复旦大学基础医学院研究员
2023.7-今 重庆医科大学基础医学院院长
荣誉与获奖
2005 云南省自然科学一等奖
2006 全国优秀博士论文
2010 上海市曙光学者
2011 上海市浦江人才
2011 上海市卫生系统优秀青年
2015 国家重大科学研究计划（973）首席科学家
2022 巴渝学者讲座讲授
2023 重庆市首席专家工作室领衔专家
2023 教育部长江学者特聘教授
国内外学术团体任职
上海市生物化学及分子生物学会，常务理事（2019-今）
中国生物化学及分子生物学会，理事（2018-今）
上海遗传学会，理事（2015-2023）
《中国生物化学与分子生物学学报》，编委（2015-今）
《生命的化学》，编委（2020-今）
Cell, Nature Cell Biology, Molecular Cell, Nature Reviews Molecular Cell Biology, Advanced Science, Nature Communications, Genome Biology,Nucleic Acids Research, Cell Research, Oncogene等期刊审稿人
基金项目
1. 2022.1-2026.12 国自然重点项目：“核基质蛋白对染色质高级结构的调控功能及机制研究”,283万元，负责人
2. 2022.1-2026.12 科技部重点研发计划：“干细胞命运决定过程中胞核内无膜颗粒结构的调控功能和分子机制”,635万元，子课题负责人
3. 2015.1-2019.8 国家重大科学研究计划（S-973）：“长非编码RNA在精子发生中的功能及机制”，2500万元，首席科学家
4. 2014.1-2017.12 国自然面上项目：“小鼠胚胎干细胞定向分化中异染色质域与核纤层的相互作用”，90万元，负责人
5. 2018.1-2021.12 国自然面上项目:“核基质相关长非编码RNA NMALT1对肝脏脂代谢及三维基因组的调控作用及机制研究”，60万元，负责人
6. 2018.12-2021.12 重点研发计划项目：“精子发生的调节机制”，163万元，学术骨干
7. 2011.1-2015.12 973计划重大科学问题导向项目：“非编码RNA在干细胞命运调控中的功能及分子机制”，230万元，学术骨干
8. 2011.1-2013.12 国家基金委重大研究计划/培育项目：“胚胎干细胞定向分化中大片段异染色质修饰的全基因组动态及"上锁"假说”，60万元，负责人
代表性论文(*通讯作者，#共同第一作者)
1. Huo X, Ji L, Zhang Y, Lv P, Cao X, Wang Q, Yan Z, Dong S, Du D, Zhang F, Wei G, Liu Y, Wen B*. The Nuclear Matrix Protein SAFB Cooperates with Major Satellite RNAs to Stabilize Heterochromatin Architecture Partially through Phase Separation. Molecular Cell. 2020 Jan 16;77(2):368-383.
2. Fan H#, Lv P#, Huo X, Wu J, Wang Q, Cheng L, Liu Y, Tang QQ, Zhang L, Zhang F, Zheng X, Wu H, Wen B*. The nuclear matrix protein HNRNPU maintains 3D genome architecture globally in mouse hepatocytes. Genome Research. 2018 Feb;28(2):192-202.
3. Zhang Y#, Cao X#, Gao Z#, Ma X#, Wang Q, Xu X, Cai X, Zhang Y, Zhang Z, Wei G*,Wen B*. MATR3-antisense LINE1 RNA meshwork scaffolds higher-order chromatin organization. EMBO Rep. 2023 Aug 3;24(8):e57550.
4. Ming H#, Wang Q#, Zhang Y, Ji L, Cheng L, Huo X, Yan Z, Dang Y and Wen B*. The nuclear bodies formed by histone demethylase KDM7A. Protein & Cell. 2021 Apr;12(4):297-304.
5. Wang Y#, Hong Q, Xia Y#, Zhang Z*, Wen B*. The Lysine Demethylase KDM7A Regulates Immediate Early Genes in Neurons. Advanced Science. 2023 Aug: 10(28):e2301367.
6. Sun Z#, Zhu M#, Lv P, Cheng L, Wang Q, Tian P, Yan Z, Wen B*. The Long Noncoding RNA Lncenc1 Maintains Naive States of Mouse ESCs by Promoting the Glycolysis Pathway. Stem Cell Reports. 2018. 11(3):741-755.
7. Hu S#, Lv P#, Yan Z, Wen B*. Disruption of nuclear speckles reduces chromatin interactions in active compartments. Epigenetics & Chromatin. 2019 Jul 17;12(1):43.
8. Wen B, Wu H, Shinkai Y, Irizarry R and Feinberg AP*. Large histone H3 lysine-9 dimethylated chromatin blocks distinguish differentiated from embryonic stem cells. Nature Genetics. 2009. 41: 246-50 (Cover story).
9. Doi A#, Park IH#, Wen B#, Murakami P, Aryee M, Irizarry R, Herb B, Ladd-Acosta C, Rho J, Loewer S, Miller J, Schlaeger T, Daley GQ and Feinberg AP*. Differential methylation of tissue- and cancer specific CpG island shores distinguishes human induced pluripotent stem cells, embryonic stem cells and fibroblasts. Nature Genetics. 2009 41(12):1350-3.
10. Wen B*, Xie X, Gao S, Li H, Shi H, Song X, Qian T, Xiao C, Jin J, Su B, Lu D, Chakraborty R, Jin L*. Analyses of genetic structure of Tibeto-Burman populations reveals sex-biased admixture in southern Tibeto-Burmans. Am. J. Hum. Genet. 2004. 74: 856-65.
