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杨长红
副研究员,硕士生导师
招生专业:生物信息学
研究方向:生物信息学
通讯地址:重庆市渝中区医学院路1号重庆医科大学
电子邮箱(电话):changhong@cqmu.edu.cn

个人简介

副研究员、硕士生导师、理学博士。2019年加入重庆医科大学。担任重庆市生物信息学会理事、重庆市生物信息学会血液病专业委员会委员、重庆市生物信息学会肿瘤信息学专业委员会委员。主持及参与国家自然科学基金重点项目、国家自然科学基金面上项目、重庆市自然科学基金等省部级项目9余项。在学术刊物发表学术文章10余篇。

教育背景及工作经历

2003-2007 石河子大学园艺、计算机科学与技术 双学士

2007-2010 石河子大学果树遗传育种与分子生物学 硕士

2010-2011 国家基因组北方研究中心 生物信息学工程师

2012-2015 北京生命科学研究所 科研助理

2015-2019  北京师范大学生命科学学院生物化学与分子生物学 博士

2019-2021 重庆医科大学基础医学院基础医学 博士后

2022-2023 北京大学生命科学学院生物信息学  访问学者

2021-至今 重庆医科大学基础医学院生物信息学教研室 副研究员

学术兼职

2023-至今 重庆市生物信息学会理事

2022-至今 重庆市生物信息学会血液病专业委员会委员

2021-至今 重庆市生物信息学会肿瘤信息学专业委员会委员

主持和参加科研项目

2020-2023,重庆市科学技术局自然科学基金,大数据鉴定孤独症生物标志物,主持。

2022-至今,国家重点研发计划青年科学家项目合作项目的食管癌变全景描绘及精准早筛方案构建研究,参与。

2021-至今,重庆医科大学未来医学青年创新团队,脑血管疾病的炎症免疫机制与精准治疗研究团队,参与。

2020-至今,国家自然基金面上项目,Nfat5 通过诱导 NLRP6 炎性复合体的激活促进脑缺血再灌注损伤的作用及机制研究,参与。

2020-至今,国家自然基金面上项目,HDAC3 通过调节脂质生成-糖酵解途径影响胶质母细胞瘤生长的机制研究,参与。

2020-2023,重庆市自然基金面上项目,PINK1/Parkin/FBXO7 复合物介导的泛素型线粒体自噬在脑缺血再灌注损伤中的作用及机制研究,参与。

2020-2023,重庆市教委科技项目,PINK1/FBXO7 通路介导的泛素型线粒体自噬减轻脑缺血再灌注损伤的作用及机制研究,参与。

2015-2018,国家自然科学基金重点项目,人体基因组嵌合突变鉴定与定量的生物信息新方法开发及突变规律挖掘,参与。

2012-2015973 计划,孤独症及相关儿童精神神经疾病的遗传和免疫病因及相关治疗研究,参与。

代表性论文、专利

1. Chen JL, Luo J, He J, Jiang XY, Jiang N, Yang CH*, Zhong SX*. Cell Cycle-Related Gene SPC24: A Novel Potential Diagnostic and Prognostic Biomarker for Laryngeal Squamous Cell Cancer. Biomed Res Int. 2023 Jan 21;2023:1733100.

2. Luo J, Jiang N, Chen JL, Yu G, Zhao J, Yang CH*, Zhao Y*. Inhibition of miR-423-5p Exerts Neuroprotective Effects in an Experimental Rat Model of Cerebral Ischemia/Reperfusion Injury. Neuroscience. 2022 Nov 1;503:95-106.

3. Yang CH, Chen JL, Yu Z, Luo J, Li XM, Zhou BY*, Jiang N*. Mining of RNA Methylation-Related Genes and Elucidation of Their Molecular Biology in Gallbladder Carcinoma. Front Oncol. 2021 Feb 25;11:621806.

4. Yang XX#, Yang CH#, Zheng XN#, Xiong LX, Tao YT, Wang M, Ye AY, Wu QX, Dou YM, Luo JY, Wei LP*, Huang AY*. MosaicBase: A knowledgebase for postzygotic mosaic variants for non-cancer diseases and asymptomatic human individuals. GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS, 2020, 18(2): 140-149.

5. Yang CH, Li JR, Wu QX, Yang XX, Huang Y, Zhang J, Ye YX, Dou YM, Yan LL, Zhou WZ, Kong L, Wang M, Ai C, Yang DC, Wei LP. AutismKB 2.0: a knowledgebase for the genetic evidence of autism spectrum disorder. Database, 2018, 1:8.

6. Yang L, Yang CH, Yang LY, Meng CC, Zeng LG, Li Y, Zhao J. Transcription Factor Forkhead Box P (Foxp) 1 Reduces Brain Damage During Cerebral Ischemia-Reperfusion Injury in Mice Through FUN14 Domain-containing Protein 1. Neuroscience. 2023 Oct 15;530:1-16.

7. Luo J, Chen JL, Yang CH, Tan JY, Zhao J, Jiang N*, Zhao Y*. 6-Gingerol protects against cerebral ischemia/reperfusion injury by inhibiting NLRP3 inflammasome and apoptosis via TRPV1 / FAF1 complex dissociation-mediated autophagy. Int Immunopharmacol. 2021 Nov;100:108146.

8. Zhou BY, Yang CH, Yan X, Shi ZR, Xiao H, Wei XF, Jiang N, Wu ZJ. LETM1 Knockdown Promotes Autophagy and Apoptosis Through AMP-Activated Protein Kinase Phosphorylation-Mediated Beclin-1/Bcl-2 Complex Dissociation in Hepatocellular Carcinoma. Front Oncol. 2021 Jan 21;10:606790.

9. Zhou WZ, Zhang J, Li ZY, Lin XY, Li JR, Wang S, Yang CH, Wu QX, Ye AY, Wang M, Wang DD, Pu TZ, Wu YY, Wei LP. Targeted re-sequencing with a comprehensive gene panel for autism spectrum disorder in a Chinese cohort. Human Mutation, 2019,2,14

10. Dou YM, Yang XX, Li ZY, Wang S, Zhang Z, Ye AYX, Yan LL, Yang CH, Wu QX, Li JR, Zhao BX, Huang AY, Wei LP. Post-zygotic single nucleotide mosaicisms contribute to the etiology of autism spectrum disorder and autistic traits and the origin of mutations. Human Mutation, 2017, 1002-1013.