个人简介
副教授、硕士生导师、生物信息学博士，海外高层次引进人才。2020年加入重庆医科大学，现任基础医学院生物信息学教研室副主任。担任重庆市生物信息学学会理事、中国微循环学会转化医学会等多个专业委员会委员、《重庆医科大学学报》青年编委。从事生物信息学相关的科研与教学工作。主持国家级、省部级、市级自然科学基金项目各1项，参与多项国家级、省部级自然科学基金项目。在学术刊物GPB、MCP等国际知名发表学术文章15篇，多次特邀在ICIBM等领域内国际顶级会议中做演讲报告。承担本科生、研究生多门课程的教学工作，主持校级教改项目1项。获欧美同学会第二届“双创”大赛大数据智能化产业赛区创意组三等奖，重庆市2023大学生职业规划大赛优秀指导教师。此外，指导多名研究生和本科生的科研工作。所指导的研究生发表多篇SCI论文、在国际学术会议上做英文口头报告、获国家奖学金、获评重庆医科大学“科技创新先进个人”；所指导的本科生获首届全国大学生职业规划大赛全国总决赛银奖、成渝地区双城经济圈首届大学生职业规划大赛冠军争夺赛金奖、重庆市2023大学生职业规划大赛金奖、重庆市优秀毕业论文、重庆医科大学优秀毕业论文。
教育背景及工作经历
2008-2012 西南交通大学生物信息学专业 学士
2012-2017 中国科学院大学生物信息学专业 博士
2018-2020 美国印第安纳大学医学院 Assistant Scientist
2020-至今 重庆医科大学基础医学院生物信息学教研室 副教授
学术兼职
2023-至今 《重庆医科大学学报》青年编委
2023-至今 重庆市生物信息学学会理事
2023-至今 中关村肿瘤微创治疗产业技术创新战略联盟精准医学专业委员会委员
2023-至今 中国研究型医院学会临床数据与样本资源库专业委员会委员
2022-至今 重庆生物信息学肿瘤信息学专业委员会委员
2022-至今 重庆生物信息学血液病专业委员会委员
2020-至今 中国微循环学会转化医学专业委员会委员
奖项及荣誉
2024年，重庆市2023大学生职业规划大赛，优秀指导教师
2021年，欧美同学会第二届“双创”大赛大数据智能化产业赛区，国际三等奖
主持科研项目
2021年，国家自然科学基金青年项目
2022年，重庆市科技局博士“直通车”科研项目
2022年，重庆市教委科研基金青年项目
代表性论文（近5年5篇代表作）
1. Wei W#, Ye B#, Huang Z, Mu X, Qiao J, Zhao P, Jiang Y, Wu J*, Zhan X*. Prediction of Prognosis, Immunotherapy and Chemotherapy with an Immune-Related Risk Score Model for Endometrial Cancer. Cancers (Basel). 2023 Jul 19;15(14):3673.
2. Zhan X, Liu Y, Jannu AJ, Huang S, Ye B, Wei W, Pandya PH, Ye X, Pollok KE, Renbarger JL, Huang K, Zhang J. Identify potential driver genes for PAX-FOXO1 fusion-negative rhabdomyosarcoma through frequent gene co-expression network mining. Front Oncol. 2023 Jan 30;13:1080989.
3. Lu Z#, Zhan X#, Wu Y, Cheng J, Shao W, Ni D, Han Z, Zhang J, Feng Q, Huang K. BrcaSeg: A Deep Learning Approach for Tissue Quantification and Genomic Correlations of Histopathological Images. Genomics Proteomics Bioinformatics. 2021 Dec;19(6):1032-1042. doi: 10.1016/j.gpb.2020.06.026. Epub 2021 Jul 17.
4. Zhan X, Liu Y, Yu CY, Wang TF, Zhang J, Ni D, Huang K. A pan-kidney cancer study identifies subtype specific perturbations on pathways with potential drivers in renal cell carcinoma. BMC Med Genomics. 2020 Dec 28;13(Suppl 11):190.
5. Zhan X, Cheng J, Huang Z, Han Z, Helm B, Liu X, Zhang J, Wang TF, Ni D, Huang K. Correlation Analysis of Histopathology and Proteogenomics Data for Breast Cancer. Mol Cell Proteomics. 2019 Aug 9;18(8 suppl 1):S37-S51.
