一、生物信息学专业及生物信息学教研室简介

生物信息学专业：结合我校“立足重庆、服务中国、面向世界”的办学定位和大数据时代对生物信息学人才日益增长的需求，重庆医科大学于2013年建立生物信息学专业，旨在培养“掌握医学、生物学和信息学等多学科基本理论，具备生物信息收集、加工、分析、利用等基本技能”的高水平复合型人才。为健康中国战略计划提供生物信息学人才支持，为高校、科研机构、医院、公共卫生等相关部门与行业提供生物信息学相关的高质量后备人才。

生物信息学教研室：生物信息学教研室创建于2013，现有教师12人，其中博士学历9人，博士后经历5人。其中教授1人，副教授及副研究员6人，硕士研究生导师7人，多名教师具有国内外访学经历。目前教研室已累计培养七届本科毕业生，毕业总人数250人。培养硕士、博士生共计30余人 。2019年获批生物信息学二级学科硕士点，在病理学与病理生理学专业上招收生物信息学方向博士，现已形成“学士-硕士-博士-博士后”的完整人才培养体系。现任教研室主任为冉隆科，副主任为詹晓慧。

二、师资队伍

1. 冉隆科

冉隆科，男，中共党员，博士，重庆医科大学生物信息学教研室教授，硕士研究生导师，教研室主任，生物信息学专业负责人，郑州大学附属洛阳中心医院特聘教授，美国加州大学圣地亚哥分校访问学者，全国生物信息学会与系统生物学学会理事，中国生物信息学学会理事，中国生物信息学学会多组学与整合生物学专业委员会常委，重庆市生物信息学会理事长，重庆市生物信息学会肿瘤信息学分委会主委，重庆市科协科技经济融合(下一代)专家成员。电子邮箱：ranlongke@cqmu.edu.cn。

从事生物信息学相关的教学工作，作为项目负责人主持重庆市教委和重庆医科大学教改项目各1 项，参编包括全国高等学校八年制及“5+3”一体化临床医学专业第四轮规划教材《生物信息学》(第3版) 在内的教材 3 部。担任生物信息学本科专业《生物信息学》和《R语言》课程以及全校研究生《生物信息学》课程负责人，培养研究生14名,  指导多名研究生获得国家奖学金和校优秀学位论文以及2022年重庆市优秀硕士学位论文。

主要研究方向：肿瘤多组学数据分析、肿瘤早期诊断及预后的分子标志物筛选、肿瘤大数据分析平台及工具的开发。主持主研包括国家自然科学基金、重庆市科委、重庆市厅局级课题等 10 余项，在国内外期刊发表论文 30 余篇，其中第一作者或通讯作者SCI论文20余篇，10分以上1篇, 单篇最高影响因子13.944， 累计影响因子110以上, 主编专著 1 部，获国家授权专利1项。

2. 詹晓慧

詹晓慧，女，中共党员，博士，重庆医科大学生物信息学教研室副教授，硕士研究生导师，教研室副主任，海外高层次引进人才。中国微循环学会转化医学专业委员会委员，重庆市生物信息学学会委员，重庆生物信息学肿瘤信息学专业委员会委员，重庆生物信息学血液病专业委员会委员；电子邮箱：xhzhan@cqmu.edu.cn。

从事生物信息学教学与工作，承担《生物信息学专业导论》、《生物信息学》等多门课程的教学工作；荣获“2021年基础医学院教师双语讲课比赛优秀奖”，主持重庆医科大学研究生教育教学改革研究项目。

主要研究方向为生物医学大数据的整合与挖掘、生物模型的构建、精准医学图像和精准医学，通过解析组学数据、医学影像与临床数据之间的关系，探讨肿瘤的发病机理，致力精准治疗。主持国家自然科学基金项目、重庆市科技局博士“直通车”科研项目、重庆市教委科学技术研究计划项目，发表SCI论文十余篇，多次参加国际学术会议并作大会报告。获欧美同学会第二届双创大赛大数据智能化产业赛区全国三等奖。

积极参与研究生、本科生培养。所指导的研究生发表多篇SCI论文，参加国际学术会议并作英文口头报告。所指导的本科生多次获得校优秀学生奖学金及“三好学生”、重庆市“优秀毕业论文”等荣誉称号，并保送研究生。

3. 唐静

唐静，女，中共党员，博士，重庆医科大学生物信息学教研室副教授，硕士研究生导师，重庆医科大学特聘青年创新人才。担任中国药理学会分析药理学青年委员会委员，重庆市生物信息学血液病专委会委员。担任 Briefings in bioinformatics, Computational and Structural Biotechnology Journal, Computers in Biology and Medicine, Genes & Diseases,中国现代应用药学等杂志审稿人。电子邮箱：tang_jing@cqmu.edu.cn。

从事生物信息学教学与工作，承担《生物信息学软件与数据库设计》等多门课程的教学工作。

主要从事胎盘发育研究及生物信息学算法、web 软件及数据库开发等研究。近五年，已在 Nucleic Acids Research、Nature Protocols、Advanced Science、Briefings in bioinformatics、Molecular & Cellular Proteomics、The FASEB Journal、Journal of Proteomics等生物医药领域期刊上发表多篇论文，总影响因子>100， 累积他引次数>324，并获 3 篇 ESI 高被引论文，获批 3 项软件著作权，主持国自然科学基金项目，重庆市教委项目及区科委项目。于 2021 年协助申报并获批重庆医科大学未来医学青年创新团队。

指导的本科生获校级 2021，2023 届优秀毕业论文，指导的硕士研究生获 2023 校级优秀毕业论文，指导的本科生团队获第七届中国国际“互联网+”大学生创新创业大赛重庆赛区选拔赛重庆医科大学校赛二等奖，指导的硕士研究生获得国家奖学金、重庆医科大学研究生单项奖学金等。

4. 韩智杰

       韩智杰，男，博士，重庆医科大学生物信息学教研室副教授，硕士研究生导师，香江学者，重庆医科大学“未来医学青年创新团队发展支持计划”（团长），香港大学李嘉诚医学院访问学者/Honorary Research Associate，中国研究型医院学会神经再生与修复专业委员会委员，重庆市生物信息学会委员， Front Immunol、 Front Pharmacol、 Front Public Health、 Front Neurosci、 Front Genet、 Front Neurol 和 Front Neuroinform 专栏编辑；电子邮箱：zhijiehan@cqmu.edu.cn。

主要研究方向：利用生物信息学方法研究神经类疾病在基因组和转录组层面上的发病机理，以及开发相应的生物信息学算法、工具和数据库。主持国家自然科学基金青年项目一项、省部级科研项目一项、校级科研项目两项。发表相关高水平论文 17 篇。

培养本、硕、博学生十余人，并指导学生获得多项国家级奖项。

5. 刘太行

刘太行，男，中共党员，博士，重庆医科大学生物信息学教研室副研究员，硕士生导师；电子邮箱：liuth@cqmu.edu.cn。

从事生物信息学教学与工作，承担《生物信息学前沿技术》、《蛋白质组学》等多门课程的教学工作。

主要从事细胞周期与细胞命运决定及胎盘源性疾病研究，先后主持国家自然科学基金青年基金、中国博士后科学基金面上资助、重庆市博士后特别资助等国家级、省部级科研课题，以第一/通讯作者发表SCI论文十余篇。

在指导本科生创新创业方面经验丰富，获得“全国大学生基础医学创新研究暨实验设计论坛”国家级金奖、铜奖，全国大学生生命科学竞赛国家级二等奖，中国大学生五分钟科研英语演讲竞赛国家级三等奖等二十余奖项或项目资助。

6. 李胜龙

李胜龙，男，博士，重庆医科大学生物信息学教研室副研究员，硕士研究生导师。重庆市生物信息学会委员，重庆市免疫学会免疫信息学专委会委员；电子邮箱：lishenglong@cqmu.edu.cn。

从事生物信息学相关教学与工作，担任《生物信息资源与实践》课程负责人,培养和指导本硕学生多人。

主要研究方向： 多组学免疫特征分析、运用机器学习的方法进行靶向治疗的预测与分析、疾病发生发展机制相关研究。主持主研包括重庆市科委、重庆市教委等课题4项，参与其它各级课题7项。发表SCI论文20余篇，其中第一/通讯作者高水平论文3篇。申请专利10余项，其中第一发明人2项。

7. 杨长红

杨长红，女，中共党员，博士，重庆医科大学生物信息学教研室副研究员，硕士研究生导师，北京大学访问学者，重庆市生物信息学会委员；电子邮箱：changhong@cqmu.edu.cn。

从事生物信息学相关教学与工作，担任《生物数据系统设计与开发》课程负责人,培养和指导本硕学生多人。

主要研究方向：利用生物信息学方法助力疾病的研究，以及开发相应的生物信息学数据库和工具。主持重庆市科委项目1项，参与国家自然基金、重庆市科委、重庆市教委等项目9项。发表SCI论文12篇，其中第一/通讯作者高水平论文6篇。

8.刘坤艳

刘坤艳，女，中共党员，博士，重庆医科大学生物信息学教研室助理教授，重庆生物信息学会委员；电子邮箱：liuky@cqmu.edu.cn。

从事生物信息学相关教学与工作，承担《群体遗传与进化》《R语言》《基因组学》等多门课程的教学工作，获2021年重庆医科大学基础医学院教学创新设计比赛二等奖。培养和指导本科生多人。

主要研究方向：基于高通量测序数据，包括基因组、转录组、表观遗传组学数据，利用生物信息学方法探究发育异常、肿瘤发生的分子机制。主持重庆市科研基金项目一项，在《Nature communication》等杂志发表多篇SCI高水平论文。

9. 唐娅琴

唐娅琴，女，中共党员，硕士，重庆医科大学生物信息学教研室讲师，重庆市生物信息学会委员；电子邮箱：314436495@qq.com。

从事生物信息学相关教学与工作，承担《Linux操作系统》、《python程序设计》，《数据库原理及应用》等多门课程的教学工作，培养、指导本科生多名。

研究方向：数据分析及数据库搭建。在《Frontiers in Aging Neuroscience》杂志上发表SCI高水平论文。

10. 谭鹏程

谭鹏程，男，硕士，重庆医科大学生物信息学教研室讲师，华中科技大学访问学者；电子邮箱：101821@cqmu.edu.cn。

从事生物信息学相关教学与工作，承担《C语言程序设计》、《数据结构》等多门课程的教学工作，参与编写专著1部；培养、指导本科生多名。

研究方向：web servers与生信算法相结合的系统集成开发应用与实现。

在指导本科生创新创业方面经验丰富。2018年指导学生参加微软“创新杯”全球学生科技大赛，获重庆赛区创新潜力奖；2020年指导学生参加第十二届“挑战杯”中国大学生创业计划竞赛，获重庆市赛区铜奖。2020年指导本科生团队参加第十二届“挑战杯”大学生创业计划竞赛，获校赛银奖。

11.彭睿

彭睿，男，硕士，重庆医科大学生物信息学教研室讲师；电子邮箱：412617230@qq.com。

从事生物信息学相关教学与工作，承担《生物信息学》和《系统生物学》等多门课程的教学工作；培养、指导本科生多名。

主要研究方向为图论和组合理论在系统生物学中的应用。目前已在国际国内期刊发表过相关的研究论文。

12.兰洁

兰洁，女，博士，重庆医科大学生物信息学教研室讲师，电子邮箱：jielan@cqmu.edu.cn。

从事生物信息学相关教学与工作，承担《表观组学数据分析》，《高通量数据分析》等多门课程的教学工作，培养、指导本科生。

主要研究方向为基于全基因组CRISPR-screen筛选肿瘤的特异性药物靶点及相关机制的挖掘、组蛋白以及组蛋白变体对染色质结构以及基因调控作用的研究、基于深度学习构建模型对疾病状态等进行预测、结合多组学数据挖掘肿瘤发生发展过程中的关键机制。参与多项国家自然科学基金项目研究工作，在《Molecular Cancer》等杂志上发表多篇SCI高水平论文。